Henrik Skouboe kom til verden den 24. juni 1955 i Nykøbing F. Hans første klub var Nykøbing Falster Boldklub af 1901. A-landsholdskarrieren tog sin begyndelse i 1977 mod Finland i Helsinki. Kampen endte med et dansk nederlag på 1-2. Henrik Skouboe har spillet 3 kampe for det danske A-landshold.