Morten Skoubo er født den 30. juni 1980 i Holstebro. Hans første klub var Struer B. A-landsholdskarrieren tog sin begyndelse i 2003 mod Luxembourg i Luxembourg. Kampen endte med et dansk nederlag på 0-2. Morten Skoubo har spillet 6 kampe for det danske A-landshold og scoret 1 mål.
| År | Kampe | Mål | Rolle |
|---|---|---|---|
| 2003 | 1 | – | Indskiftet |
| 2004 | 1 | – | Indskiftet |
| 2005 | – | – | |
| 2006 | 2 | 1 | Starter |
| 2007 | – | – | |
| 2008 | – | – | |
| 2009 | – | – | |
| 2010 | 1 | – | Indskiftet |
| 2011 | 1 | – | Indskiftet |
| I alt | 6 | 1 |